Lai gan gan MOC, gan MOF satur metāla{0}}organiskās koordinācijas saites, pastāv būtiskas atšķirības:
Dimensijas: MOC ir 0-dimensiju diskrētas molekulas, savukārt MOF ir 2D vai 3D bezgalīgi paplašināti tīkli.
Šķīdība: Lielākā daļa MOC ir šķīstoši, savukārt MOF parasti ir nešķīstoši.
Stabilitāte: MOF parasti ir augstāka termiskā stabilitāte.
Lietojumprogrammas fokuss: MOC izceļas ar molekulāro atpazīšanu, savukārt MOF ir vairāk piemēroti gāzes uzglabāšanai.